Clostridioides difficile

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単一菌株である Faecalibacterium prausnitzii EXL01 は、胆汁酸代謝と酪酸産生を含む重要なマイクロバイオーム機能を回復させることで、糞便微生物移植に匹敵する安全性と有効性を示しながら multiple-recurrent CDI の予防に有望である。

2025年のコクランアップデートによると、プロバイオティクスは抗生物質治療を受けている患者のC. ディフィシル関連下痢（CDAD）の相対リスクを半分にすることが示唆されています（ARR 1.6%、NNT 65）。しかし、証拠の信頼性は低く、ベースラインリスクによって適用範囲が異なる。

FMTは、初発CDIに対するバンコマイシンと同様の治癒率と安全性を示し、非劣性が確認されたため、一次治療として検討される可能性がある。